很高兴能够回答您的问题，以下是我的观点：
二者难分伯仲，如果一定要分高低，我认为是台北故宫。
***转移台湾，将很多当时公认的精品（宫藏）带到台北，且基本以巧件，书画古籍为主。北京故宫有许多的精品都来自当时文化名人（民藏）的捐赠，后来随着国力逐渐强盛回流了大批流于海外的文物。
目前北京故宫的收藏物件是远大于台北故宫的，传世十大名画除《汉宫春晓》《百骏图》，其他均在北京故宫。
台北故宫的书法规模更为庞大，包括王羲之的《快雪时晴帖》怀素的《自叙帖》颜真卿的《刘使中帖》苏轼的《寒食帖》等书法精品都一一陈列在其中。
在陶瓷上，目前官方承认的汝窑中，具有代表性的大多在台北故宫，而明清瓷质量上不分伯仲。
其他玉器杂项，诸如和田玉，奇石，掐丝珐琅等物件质量上，双方也是难分上下。
我在评判价值的出发点上，是基于其时代意义与内涵，所以我认为台北故宫在价值上略胜于北京故宫，希望我的回答对于您能够有借鉴意义[祈祷][祈祷][祈祷]
中国的两个故宫博物院，一个在台北，一个在北京。见证了因为国共内战，两岸分离几十年的悲欢离合。大陆的故宫博物院大家都比较熟悉，说说台北故宫博物院，台北故宫博物院始建于1962年，1965年落成。里面文物包含了北京故宫，沈阳故宫，和原热河行宫等旧藏文物之精品。主院为于台北外双溪。另外准备嘉义县筹建新院区。
由于多种原因，许多人对北京故宫文物藏品状况不很清楚，有人以为好东西都到了台湾，有的甚至说：“台北有文物没有故宫，北京有故宫没有文物”，这显然是误解。当然，文物自有其本身的艺术价值和历史价值，是不可以互相替代的。两岸故宫的收藏本来就是一个整体，有着很强的互补性，只有从整体上来看待，才能全面地认识中华文化的源远流长和丰富多彩。
台北故宫博物院文物是北京故宫博物院文物的一部分，两院只有合在一起，才是一个完整的故宫。两院孰优?应该说是各有千秋，但都不完整。台北故宫博物院70万件藏品堪称中国文化艺术之宝库，北京故宫博物院超过了100万件的珍藏同样无人匹敌。迁台的学者当时认为金石是最重要的，鼎是国家的象征，所以拿走了不少(2382件)青铜器；文人重视书画，书画本身也好运载，能拿的尽可能拿，共拿走了5424件。其中仅宋画即达943幅，宋元山水画系列可构成台湾故宫博物院的极品特展。中国有君子佩玉之说，故玉器也拿走不少。陶瓷只拿走了一部分，计17934件，但却集中了北京故宫博物院各瓷器陈列室与敬事房的精品，可谓名窑毕备。著名的三希堂帖，北京故宫博物院藏有“三希”中的“二希”，而台北藏有其中的“一希”。郭熙的《早春图》，现在台北，北京没有。北京有《清明上河图》，台北没有。龙袍，中国历代只有清王朝留下来的，当时的学者认为清朝的东西价值不大，没有拿，所以台北故宫博物院1件龙袍也没有。
故宫博物院成立之前，逊帝溥仪将1200余件书画精品、古籍善本和大量珍宝盗运出宫。新中国成立后，其中相当部分重新回到了北京的故宫博物院，如《清明上河图》、《韩熙载夜宴图》、《五牛图》、《伯远帖》、《中秋帖》等。
1933年故宫南迁文物共13491箱，部分文物南迁后，北平故宫本院所留文物相当多，也有不少珍品，沦陷期间还在继续清点未曾登记的文物，并征集了一批珍贵文物。南京***曾下令马衡院长选择留平文物菁华装箱，分批空运南京，马院长虽将珍品编目造册报南京，但以各种理由推延装箱，后来一箱也未运走。南迁文物后来运台2***2箱，占南迁箱件数的22%，当然多是精品。其实留下的78%精品也相当多。***向台湾运文物，因战争形势突变只运了三次，第三次拟搬运1700箱，由于运输舰舱位余地有限，加之仅有24小时装船时间，结果只运出***2箱，另728箱也留在了内地。台北故宫收藏的青铜器，先秦有铭文的约500件。两岸故宫青铜器都以传世品为主，台北故宫精品上强于北京故宫，但对比国博的青铜器略逊三分。国内含台湾的话，应该是国博、台北故宫、上博前三，北京故宫第四。
台北故宫在宋代五大名窑瓷器及明代官窑瓷器收藏占优势，清代康雍乾三朝珐琅彩瓷器绝大多数都藏在台北故宫，但在其他瓷器领域，北京故宫更胜。不算陶，但算瓷器，基本就是北京故宫、台北故宫一路绝尘。PS：算彩陶的话，国博秒杀所有博物馆，包括北京故宫、台北故宫，基本合起来是他的零头。
在台北故宫玉的展览里，从新石器时代的鹰纹圭和人面纹圭，到商代的鸟纹佩，汉代玉角杯，还有那号称镇馆之宝的清代翠玉***，精品不少。整体上北京故宫和台北故宫难分伯仲。
北京故宫和台北故宫相比，哪个故宫的藏品更有价值？
应该说这两个故宫里的藏品都非常有价值，金钱是无法衡量着两个故宫里的藏品的。
如果对比也就是对比两个故宫里藏品数量和藏品的研究价值。
一、 北京故宫博物院建立于1925年10月10日，位于北京故宫紫禁城内，是在明、清两代皇宫及其收藏的基础上建立起来的综合性博物馆，其文物收藏主要来源于清代宫中旧藏。
二、台北故宫博物院建于1962年，在上世界2/30年代为躲避战乱，里面的珍贵文物经过多次辗转在1948年迁往台湾，因此才有了现在的台北故宫博物院，当然也有一部分有从新回到了北京，其实里面90%藏品都源于北京故宫博物院。
三、目前北京故宫博物院藏品数量200多万件。台北故宫博物院藏品数量大概70万件左右。
从数量上看北京故宫博物院是完胜台北故宫博物院的。其实按照当时文物南迁时的审美观，宋瓷和宋代书画等大部分都迁往了太别故宫博物院，很少有清代藏品，也可能是因为当时离清朝比较近，感觉东西都比较新没有多大欣赏和研究价值。
个人认为两家博物馆的藏品都非常具有参考和观赏性，没有可比性。必定文物这东西大都是独一无二的，存世多了也就更不值钱了。更不能说谁家的藏品更值钱，因为俩家的藏品都是中华民族几千年来的印证。
